Dette er hovedfokuset i Culton-prosjektet, grunnivået i databasen og årsaken til at prosjektet eksisterer. Å utvikle å vedlikeholde sjekklisten vil være en kontinuerlig prosess som forhåpentligvis involverer en stor gruppe frivillige moderatorer og forhåpentligvis også noen betalte medarbeidere etter hvert.
Kilder
Vi har i løpet av tiden dette prosjektet har utviklet seg arbeidet med data fra svært mange kilder. Da vi arbeidet innenfor rammen av oppdraget for planteforeningen KVANN, var det naturligvis data fra medlemmer som stod i fokus, særlig Stephen Barstows omfattende plantelister basert på mange års innhenting av data fra The Plantlist, Plants For a Future (PFAF) og mange andre kilder. I tillegg jobbet vi med data fra de norske klonarkivene, samt et eldre sett fra Nordgens SESTO- database, som nå ikke lenger vedlikeholdes etter at de gikk over til å bruke GRIN.
Vi ser nå på dette som en viktig erfaringsbakgrunn for å avdekke de problemstillingene vi har måttet løse for Culton-prosjektet, før vi kunne ta fatt på å arbeide mer systematisk med å bygge våre datasett. Det var rett og slett så mange problemer knyttet til systematikk og navning, så mange uoverensstemmelser mellom datasettene, og også feil og inkonsekvenser innad i settene, at det var vanskelig å vite hva man skulle stole på. Faktisk var dette en av grunnene til at Culton-prosjektet oppstod i det hele tatt: behovet for å samle alt dette og lage en skikkelig sjekkliste en gang for alle, og komme ut av den situasjonen at alle satt på hver sin tue og gjorde kollektivt sett dobbeltarbeide som dessuten er en stor feilkilde.
Kilder vi bruker nå:
- CropTrust’s Genesys: https://www.genesys-pgr.org/a/overview
- Eurisco Home (ipk-gatersleben.de)
- Nordisk og Baltisk genbank (GeNBIS): https://www.nordic-baltic-genebanks.org/gringlobal/search.aspx
- The Czech genebank: https://grinczech.vurv.cz/gringlobal/search.aspx
- SKUD Svensk kulturväxtdatabas: https://skud.slu.se/nav/taxa
- UPOV: https://www.upov.int/portal/index.html.en
- The lists from Theo Damen which again comes from many sources
Kultivarstatus
Som beskrevet i vår systematikk tilnærming, vi bygger på genbanktypene og MCPD for planter. For også å inkludere husdyr og mikroorganismer må vi nok justere denne listen, men prinsippet vil være det samme. Kultivartyper bli lagret i en kolonne i sorttabellen og vises i frontend der det er nødvendig.
For planter vil dataene i stor grad måtte komme fra genbankene, så vi blir avhengig av et godt samarbeid med dem, f.eks. gennom Crop Trust. Vi har innledet en dialog med dem om tilgang til Genesys-dataene.
Metode
Kultivardataene vil ligge i én hovedtabell med et synonymsystem, samt tilleggstabeller med egenskapsdata for de enkelte kultivarene.
Det første kultivar-datasettet blir til ved å fokusere på én og én avlingstype/husdyr/microorganisme (symbio) og gjennomføre følgende prosedyre:
- hente navnene som er i bruk fra kildene ovenfor
- normalisere og slå sammen dataene der det er naturlig
- beholde referansene til kildene i egne kolonner
- gi alle oppføringer unike ID-er (persistente UUID-er)
- i utgangspunktet sette alle oppføringer med status «uverifisert», dvs. at det er ikke er tatt stilling til hva som skal være akseptert og hva som skal være synonom
Når dette innledende arbeidet er gjort, vil vi utvikle et brukergrensesnitt for monitorering i frontend på culton.info. Her vil da monitoreringsteamet arbeide med verifisering av de importerte dataene, samt løpende vurdering av forslag fra publikum.
Data
Det vil ikke være hensiktsmessig å tilby en full utskrift av alle kultivarer, raser og stammer, fordi det kommer raskt til å være mange hundre tusen oppføringer. I stedet vil vi utvikle en rekke måter å søke og sette sammen informasjon på som så kan eksporteres eller skrives ut.
Vår første betaversjon av sjekklistetjenesten vil kjøre fra beta.culton.org. Her på culton.org er det utviklingsdatasett, for det meste i regnearkformat, kun for intern diskusjon og tilgang begrenset til påloggede deltakere i prosjektet. Dersom det er lagt ut slike data, lenkes det dit under her:
Sist oppdatert 2023-09-02 av Karl Aakerro